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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

黄河宁夏段累计封河长度182公里******

　　中新网银川1月31日(记者 于晶)1月31日，记者从宁夏回族自治区水利厅获悉，截至1月31日，黄河宁夏段出现三段封河，总封河长度182公里，为2016年以来最长封河距离。

　　据介绍，青石段封河上首位于兴庆区滨河黄河大桥上游4公里，封河长度139公里。青铜峡坝上封河上首位于青铜峡三道湖七队上游1公里，封河长度36公里；沙坡头坝上封河上首位于孟家湾公路大桥上游1公里，封河长度7公里。封河河段多有清沟。总流凌长度48公里，密度20%~5%；沙坡头坝上封河上首河段无流凌。

　　宁夏水利厅相关负责人表示，黄河宁夏段5天平均气温持续低于零下5度，容易封河。由于纬度较高，青石段常年封河。近期，宁夏阶段性冷空气比较活跃，青铜峡水利枢纽和沙坡头水利枢纽两库区流速平缓，水面先形成封冻，拦截上流流凌，并随着凌块的堆积，出现了长距离的封河。

　　从水文监测看，沙坡头水利枢纽以上河段出现过三次封河，分别是2007年至2008年度、2010年到2011年度和2015年到2016年度。相较于青石段，坝上凌块比较薄，封河距离短，因此封河开河比较平稳，通常不会形成大的灾害。

　　为切实做好宁夏黄河防凌工作，春节期间，宁夏防汛抗旱指挥部办公室4次调度沿河各地防凌工作开展，对黄河凌汛防范工作再安排再部署再落实。宁夏水文水资源监测预警中心强化凌情监测，加密巡测次数，充分利用无人机、视频监控、机动巡测相结合的手段，立体化掌握凌汛动态。

　　截至目前，宁夏黄河防凌形势总体平稳，没有发生人员伤亡事故，沿黄防凌工作有序开展。(完)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）